Cillian (Hääldatakse Killian) Murphy kasvas üles Iirimaal. Tema ema oli prantsuse keele õpetaja ja isa oli kooliinspektor. Alguses planeeris mees endale karjääri õigusteaduses, kuid pärast näitlejatöö avastamist muutis ta oma meelt. Tema esimene roll oli lühifilmis "Quando" (1997). Aastatel 2002-2003 sai ta hakata osalema suurfilmides nagu "28 päeva hiljem" (2002) ja "Külmale mäele" (2003). 2003. aasta filmis "Girl with a Pearl Earring" mängis ta lihunikku, olles pärielus taimetoitlane, kuid õnneks suutis ta lihalõikamise korralikult ära õppida. 2005. aastal jätkus Murphy edu meespeaosaga pingelises thrilleris "Red Eye". Samal aastal mängis ta kurjamit ulmefilmis "Batman alustab", kuigi tegelikult läks ta prooviesinemistele Batmani rolli tahtes, aga lavastajale meeldis ta nii väga, et pani ta Dr. Jonathan Crane´i osasse.