Filmi tegevus toimub kuus aastat peale seriaali lõppu ja see keskendub selgeltnägijale, kes arvab, et näeb nägemusi, mis Jumal talle saadab, aga Mulderil(David Duchovny) ja Scully'l(Gillian ANderson) on kahtlus, et selle taga on kõike muud, kui Jumal.

Mulder jätkab oma teekonda tõe suunas ja Scully jääb teda toetama. Selle filmi käigus arenevad Scully ja Mulderi suhted hoopis teises suunas, kui seda oli esimeses filmis ja seriaalis.