Konflikti lõpp juba vaatevinklis, otsustab Maa Föderatsioon tuua sõda Zeoni hertsogiriigi koduterritooriumile. Gundami piloot Amuro Ray, nüüdseks juba vilunud veteran, naaseb kosmosesse et võidelda viimases lahingus. Siin kohtub ta müsteerilise Lalah Sunega, noor naine, kes jagab temaga NewType oskuseid. Amuro vastane Char Aznable aga otsib teda, lootuses täita oma kättemaks.

Film põhuneb sarja osadel 31-43, kuigi mõningaid klippe on lisatud ning eemaldatud.