See on meie lähitulevik. Lapsed sünnivad koos ühe väikese lisateguriga nende geenides, mis annab neile üleloomulikud võimed ja teeb neist "mutandid". Senaator Robert Kelly (Bruce Davison) on selle uue seemne vastu võitlemiseks kogu ühiskonna nende vastu pöörand. Olukord viib kaks mutantide juhtfiguuri, Magnetto (Ian McKellen) ja proffessor Xavier'i (Patrick Stewart) vastaseisu. Xavier üritab probleemi lahendada rahumeelselt, Magneto seevastu loob relva, mis kõik inimesed võrdseks teeks. Võrdsuse all näeb tema seda, et kõik oleksid mutandid. Et Magnetot peatada, asutab Xavier erilise mutantide ühingu nimega X-mehed, kuhu ta kutsub ainult vähesed, kõige usaldusväärsemad ja tugevamad mutandid.