1868. aastal, pärast Bakumatsu sõja lõppu, lubab endine palgamõrvar Kenshin Himura kaitsta hädasolijaid. Kenshin rändab Jaapanis oma mõõgaga samuraiajastu üleminekul uuele ajale. Kui Kenshin aitab idealistlikku Kaoru Kamiyat võimsa oopiumiravimite isanda Kanryuu Takeda vastu, kes soovib tema kooli oma oopiumi tootmiseks. Kuid narkokeemik Megumi Takani põgeneb Kanryuust ja otsib koolist varju. Vahepeal tapab Battosai politseiametnikke ja jätab nende kehadele sõnumeid. Kui Kanryuu mürgitab elanikke kooli saamiseks, ühendavad Kenshin ja tänavavõitleja Sanosuke Sagara jõud, et rünnata oma ühist vaenlast.