Tuhat aastat on möödunud sõjast, milles hävines peaaegu täielikult inimtsivilisatsioon. Järele jäid vaid mõned üksikud asutatud kohad, nende hulgas ka kindlus nimega Tuulte Org, mida valitseb vapper printsess Nausicaä. Ümberringi on aga kõik metsad ja seal kasvavad taimed eluohtlikud inimestele, mürgitades ettevaatamatu hinge kokkupuute korral. Nausicaä on printsess, kes üritab loodust mõista, mitte võidelda selle vastu, nagu palju teised inimesed teevad, ajades vihale loodust kaitsevad hiigelolendid, keda kutsutakse Ohmudeks. Mõistes roheluse vajalikkust ja püüdes kaitsta kõiki seal elavaid liike, proovib printsess leida lahendust, kuidas inimese suhe loodusega jälle sõbralikuks sümbioosiks muuta.