Yugi Moto paneb ühel päeval koku vanast Egiptusest pärineva Milleeniumi Puzzle ja lahendab selle saladuse. Puzzles peituva vaimu abiga võidab ta Seto Kaiba, Duelli tšempionit. Selle peale ilmub Duelli looja Max-A-Million Pegasus ja röövib Yugi vanaisa hinge. Crawford tahab Yugi duellantide saarele meelitada, et Puzzle enda valdusesse saada. Saarel kohtab Yugi nii uusi sõpru kui ka vaenlasi. Lõpuks Yugi võidab, kuid tema reis on alles alanud ja ees seisavad veel loendamatud võistlused, mis lisaks au ja kuulsuse kogumisele mõjutavad maailma saatust.