Universaalsajandi aastal 0079 leiutab Zeoni liit gigantse inimeselaadse relva nimega robotmunder ja alustab iseseisvussõda Maa Föderatsiooni vastu. Lugu kujutab noorte poiste ning neidude elu sõjas, keskendudes peategelasele Amuro Rayle. Amuro hakkab Gundami piloodiks, robotmundri prototüüp mis on valmistatud Föderatsiooni poolt. Läbi lahingute Zeoni piloodi Char Aznable vastu ja paljude teiste väljakutsete vastu, hakkab Amuro aru saama oma unikaalsusest NewTypena.